拜谱生物

400-820-8531
News center
拜谱生物
首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > HEATag:单上皮细胞测序子样本标志新方案,低代价、跨动物群、全网站兼容!

HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体动物群特女性朋友、寡核苷酸表达利润高或操作步骤流量非常复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导队伍在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低价格、跨植物物种、全手机平台兼容的全新解决方案。

学术期刊详细资料

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国科学实验合理有效院基因显性基因的性与成长发育菌物学分析所和我国基因显性基因的性学得会举办的国际上科研刊物杂志,秉承于简报生命图片科学实验合理有效和医学界基因显性基因的性学前沿技术的创作者性分析成效。JGG 2028年度导致因素7.1,Scopus科研刊物杂志评议完成指标CiteScore 9.9,位于JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY前沿技术Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY前沿技术Q1区,位于我国科学实验合理有效院刊物杂志系统盘菌物学专业类别1区(Top刊物杂志),基因显性基因的性学和生化学与团伙菌物学小类双1区。

BIOPROFILE

一些 是HEATag

精巧的“二合并”设计构思

HEATag是由凝集素和HUH内切酶带来的相结合蛋清

「位置定位器」模快 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「拼接器」方案 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引长条码做共价接。

“1+1>2”的目的:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样本量标志与产品追溯。

Fig1: HEATag重量符号远离示图图

BIOPROFILE

操作验证

HEATag知乎问答有可以打?

行在不一样的环境下,建立喂奶家禽肿瘤神经细胞系单肿瘤神经细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。探讨精英团队为 HEATag 布置了多轮 “有压力測試”,从生殖神经细胞系到生殖神经细胞,从恒温到低温环境,从新鲜范例到紧固范例,全地方认可它的靠谱性和靠谱性。

1轮测验对应母乳喂养昆虫上皮内部系:研发技术人员采用了来源于人、鼠、仓鼠二个植物动物群的四类上皮内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在室内温度下使用 HEATag 标示后交织测序。终于回收利用的 11447 个上皮内部中,85.66% 都能能够 HEATag 长方形码查询准确无误输入到原植物动物群,样品间交错式造成的污染不多,UMAP 聚类浅析浅析亦是间接证件,HEATag 长方形码查询与植物动物群特异形DNA组功能间距共同。 没过多久,公测生活具体必要条件进十步提高:探讨相关人员测试在 4℃下标出鲜活受损神经内部、在常温下标出甲醇确定受损神经内部,或是直接性标出受损神经内部核。致使已然吸睛:其他生活具体必要条件下,范例标价签与种群数据信息均具最好的相关性分析,分割准确无误率超 95%。也许甲醇确定会致使轻柔的转录本交叠生态破坏,受损神经内部核备制就会有一点 RNA 减少,受损神经内部方式的批注致使已然与鲜活范例要保持相一致,证实 HEATag 是可以标出区别工作生活具体必要条件下的實驗范例。

Fig2: HEATag 可在的不同状态下完成任务单血细胞转录组混样阐述

能够标出辅乳家禽和海洋生物无脊椎骨家禽的原代受损细胞

假若说受损上皮细胞系测验是 “条件题”,那机构模板就是说 “扣除题”, 这样的模板并不是因受损上皮细胞方式有难度、大环境适用于性特出,当上记号技術的 “疑难问题”,而 HEATag 恰恰恰在这样的 “疑难问题” 上显现了优点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织化,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅仅能被更准确辩别,所有重点组织款式的聚类算法结论都清洗可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海底怪物的替换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长条码与植物物种转录组极具较高相同性,没得经常出现因高盐坏境影响的 “标上出现异常”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可实行哺乳期小动物集体模板诸多 scRNA-seq 研究

Fig4: HEATag可推动最新鲜浅海无脊柱爬行动物许多 scRNA-seq 剖析

HEATag与受损细胞的整合不是出现转录组的正相关变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在进行标示日常任务的同時,没有对前因后果的转录多组分析会导致干涉,确保了研究探讨信息的真识性。

Fig5: HEATag不用直接影响样表的 RNA 展现玩法

BIOPROFILE

今后可期

HEATag 能为单上皮细胞学习分享啥子?

HEATag 的價值,远不知于 “处理标记符号故障”,它的协调性性和普遍性,目前在为单血细胞探究拆开更好地或者性

从利用情况来

HEATag 能遮盖从 “简便较好数据分析”(如癌安排化与通常安排化、中药加工处理与差表)到 “大批性研发”(如安排化人体人体细胞图谱编写、mtk量挑选)的全依据使用需求。如今 PIP-seq、Stereo-cell 等新方法可發展方法的發展,HEATag 还能进第一步提拔单人体人体细胞研发的通量,力助科技研究销售团队深入推进更高批性的品牌。

从跨教育领域有潜力看到

HEATag 往往可应用于于转录组学,还能与表观什么是基因组学、蛋白酶质组学、服务器组学等技術综合,还就能够通过制定指数和寡核苷酸编码序列,HEATag 还就能够轻轻松松融入到有所不同的组学程序,不引响数字信号截获深层。此外,鉴于HEATag还还就能够发展壮大单生殖细胞糖组学科学研究技術。

BIOPROFILE

加盟的动态

拜谱生物体与陈凯讲师确立进行配合需求

直得加关注的是,在 HEATag 技能展显出出很大软件应运实力的背景图下,拜谱菌物已与杭州地区浮游微生物环境科学课与工业杭州實驗室(武汉)陈凯讲解制定阶段性媒体合作有意向的客户。当事人计划书环绕 HEATag 技能的加工业化立式、教学科技事情转换等方位拉开深度1警税,确保相应低直接费用、跨种群的单内部标出技能最快软件应运于合理教学科技事情情况,为其他實驗室提供了科学规范、经济社会的单内部探索用具,保驾护航教学科技事情事情者在内部菌物学、浮游微生物环境菌物学、肠道疾病制度等各个领域达成其他挑战
拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物